من أجل تدعيم عملياتها فى مصر، تعمل هيئة كير داخل إطار الاتفاق الأساسى الذى تم توقيعه مع الحكومة المصرية فى 17 يونيه 1976. وترتبط هيئة كير بعلاقة عمل وطيدة مع وزارة التأمينات والشئون الاجتماعية، التى تتولى تسجيل وتنظيم جميع المنظمات  غير الحكومية المحلية. واعترافا بعمل الهيئة فى مجال التنمية ، تم مؤخرا توقيع مذكرة تفاهم، تتيح للهيئة الاستمرار فى العمل فى سبع محافظات فى وسط وجنوب الصعيد. ومازالت هيئة كير تتلقى موافقة المحافظين فى كل محافظة على استمرار و/ أو توسيع نطاق عملياتها.

وتقوم مشروعات هيئة كير أيضا على العلاقات المؤسسية القوية القائمة مع أجهزة الحكم المحلى وغيرها من مؤسسات التنمية المحلية الأخرى. ويتم تشكيل لجان استشارية على مستوى المناطق، والمحافظات، وعلى المستوى الوطنى، وتضم ممثلين من الهيئة، ووزارة التأمينات والشئون الاجتماعية، وممثلين من الوزارات التنفيذية، ووحدات التنمية المحلية، وغيرها. ويتمثل دور اللجان الاستشارية بالمناطق، والمحافظات، واللجان الاستشارية المركزية فى توجيه استراتيجيات البرامج خلال عملية وضعها، وإقامة شبكات عمل وآليات للتنسيق، واستغلال الموارد المناسبة، وتقاسم المعلومات، واستخلاص الدروس المستفادة.